T.P Sông Công hiện có 135ha mặt nước nuôi trồng thủy sản. Những năm gần đây, lĩnh vực nuôi trồng thủy sản trên địa bàn thành phố có những chuyển biến tích cực, nhiều diện tích đã được chuyển sang nuôi thâm canh và bán thâm canh với các đối tượng nuôi có giá trị kinh tế cao như: Cá lăng, ba ba, ếch, ốc nhồi...
Năm 2021, sản lượng thủy sản của toàn thành phố đạt trên 620 tấn, tương đương 100% kế hoạch.
Với mục tiêu phát triển nông nghiệp theo hướng hàng hóa, T.P Sông Công phấn đấu đến năm 2025, diện tích nuôi trồng thủy sản tăng lên 150ha, sản lượng đạt trên 690 tấn.
Để thực hiện mục tiêu này, địa phương tiếp tục chỉ đạo các xã, phường khai thác, sử dụng có hiệu quả tiềm năng, lợi thế về diện tích đất, mặt nước và các nguồn lực để phát triển thủy sản. Đồng thời, khuyến khích, đầu tư tăng diện tích nuôi thâm canh đối với ao gia đình bằng các loại giống cá có năng suất và giá trị kinh tế cao; đẩy mạnh phát triển các vùng nuôi, trồng thuỷ sản thâm canh tập trung đối với tổ hợp tác. Đặc biệt, thành phố cũng định hướng các vùng sản xuất thủy sản chuyên canh tập trung tại các xã, phường có lợi thế về ao, hồ như: Bình Sơn, Lương Sơn, Châu Sơn…