T.X Phổ Yên hiện có trên 500km kênh mương, 51 hồ chứa, 46 trạm bơm… Để đảm bảo sản xuất nông nghiệp thuận lợi và có hiệu quả, 5 năm trở lại đây, từ các nguồn vốn khác nhau, Thị xã đã đầu tư trên 56 tỷ đồng thực hiện 100 dự án cứng hóa, cải tạo nâng cấp hệ thống đê điều, kênh tưới tiêu và trạm bơm, hồ đập, đảm bảo tưới tiêu chủ động cho 7.657ha đất sản xuất nông nghiệp.
Để các công trình thủy lợi phát huy hiệu quả, hằng năm, Thị xã đã chỉ đạo các địa phương tích cực làm thủy lợi nội đồng, tu sửa hệ thống kênh mương; tuyên truyền, vận động nhân dân nâng cao tinh thần trách nhiệm, bảo vệ công trình; thường xuyên rà soát, kiểm tra các công trình thủy lợi bị hư hỏng do mưa, bão gây ra để kịp thời khắc phục, nâng cấp, sửa chữa. Cùng với đó, các địa phương cũng đã thành lập ban chỉ huy phòng, chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn theo phương châm 4 tại chỗ, đầu tư trang thiết bị và có kế hoạch ứng phó với các tình huống cụ thể, đảm bảo đủ điều kiện đáp ứng yêu cầu khi có tình huống xảy ra; 100% cán bộ tham gia công tác phòng, chống thiên tai được tập huấn thường xuyên, duy trì và củng cố đội xung kích phòng, chống thiên tai nòng cốt là lực lượng dân quân, đáp ứng yêu cầu khi có sự cố...