Sau một ngày thẩm vấn, tranh luận và nghị án HĐXX đã tuyên bác toàn bộ lời khai vu khống của Phan Xuân Tùng đối với ông Trần Ngọc Xuân – Phó Giám đốc Sở KHĐT và giữ nguyên mức án sơ thẩm 20 năm tù đối với Tùng về tội ''Nhận hối lộ'', đồng thời tuyên trả lại cho Tùng 1.000USD mà Tùng nộp dư, tuyên phạt Thành 11 năm tù về tội ''Môi giới hối lộ'' (giảm 1 năm so với bản án sơ thẩm).
Đầu tháng 8/2006, Phan Xuân Tùng là chuyên viên hợp đồng của Sở KHĐT tỉnh Khánh Hòa, được giao nhiệm vụ trực tiếp giải quyết đơn xin cấp phép đầu tư khu du lịch nghỉ dưỡng cao cấp tại Bắc bán đảo Cam Ranh của Công ty Sky Resort.
Trong quá trình thực hiện nhiệm vụ được giao, theo các trình tự quy định của Luật Đầu tư nước ngoài và các văn bản pháp luật liên quan, để tham mưu cho lãnh đạo Sở KHĐT có văn bản lấy ý kiến của các cơ quan liên quan và tham mưu cho UBND tỉnh Khánh Hòa cấp giấy phép đầu tư; Tùng thông qua Nguyễn Trung Thành là người phiên dịch cho Lee Sang Hyoek, yêu cầu Lee phải chi một khoản tiền làm dịch vụ để giải quyết nhanh hồ sơ; về phía nhà đầu tư để nhanh có giấy phép đầu tư.
Theo đó, Lee đã 6 lần đưa tiền theo sự thỏa thuận của hai bên thông qua Thành, sau mỗi lần có văn bản đồng ý cho thực hiện dự án của các cơ quan liên quan. Tùng đã nhận tổng cộng 71.000USD (tương đương 1.135.802.920 VND) từ Lee Sang Hyoek; Tùng chia cho Thành 2 lần với số tiền 2.000USD (tương đương 31.981.740 VND). Sau khi vụ việc được phát hiện Tùng đã trả lại cho Lee 60.000USD; nộp cơ quan điều tra 10.000USD.
Trước đó, tại phiên tòa phúc thẩm ngày 22/8,Tùng khai mọi việc Tùng làm đều có sự chỉ đạo của ông Trần Ngọc Xuân, Phó Giám đốc Sở KHĐT. Lần đầu khi ông Lee Sang Hyoek (gọi tắt là ông Lee) đưa Tùng 2.000USD, Tùng về có báo cáo lại và đưa số tiền này cho ông Xuân, ông Xuân lấy 1.500USD và đưa Tùng 500USD.
Theo lời Tùng, những lần tiếp theo, sau khi ông Lee đưa tiền Tùng đều về nói cho ông Xuân biết và ông Xuân bảo Tùng mở tài khoản rồi gửi vào ngân hàng để tính sau và Tùng đã làm theo như vậy, nên khi nhà đầu tư đòi lại tiền, Tùng cũng báo cho ông Xuân biết và ông Xuân bảo Tùng rút ra trả lại cho nhà đầu tư...
Trước những lời khai trên của Tùng, HĐXX đã phải hoãn phiên tòa để triệu tập thêm những người có quyền lợi nghĩa vụ liên quan đến vụ án và người làm chứng cũng như VKS sẽ xác minh thêm những chứng cứ mới. Tuy nhiên, theo HĐXX thì lời khai của Tùng không có căn cứ.
Riêng nhà đầu tư nước ngoài Lee Sang Hyoek được miễn truy cứu trách nhiệm hình sự về tội “Đưa hối lộ” do không nắm vững luật pháp Việt Nam và nóng lòng muốn có giấy phép đầu tư nên đã nghe lời Thành đưa hối lộ cho Tùng.
Sau đó đã chủ động tìm mọi cách báo cáo với UBND tỉnh Khánh Hòa trước khi vụ việc bị phát giác. Nên cũng theo quy định tại điều luật này, ngày 26/10/2007, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Khánh Hòa đã ra quyết định đình chỉ vụ án hình sự “Đưa hối lộ” đối với ông Lee.