Giai đoạn 2016-2020, nguồn kinh phí thực hiện Chương trình bảo vệ, chăm sóc trẻ em trên toàn tỉnh đạt hơn 18,4 tỷ đồng. Bao gồm: Trung ương cấp hơn 5,3 tỷ đồng; tỉnh cấp 6,3 tỷ đồng; Quỹ Bảo trợ trẻ em và huy động từ các tổ chức quốc tế 6,8 tỷ đồng. Đây là nguồn lực được triển khai thực hiện thông qua kênh của Sở Lao động, Thương binh và Xã hội.
Nhằm tăng thêm nguồn lực cho hoạt động này, ngoài số tiền trên, tỉnh chủ động cấp hỗ trợ tiền thù lao cho đội ngũ cộng tác viên làm công tác bảo vệ, chăm sóc trẻ em, gồm 3.100 người, với mức hỗ trợ 150.000 đồng/người/tháng. Tuy nhiên từ năm 2020, theo Nghị quyết số 07/NQ-HĐND ban hành ngày 11/12/2019 của HĐND tỉnh, đội ngũ cộng tác viên không còn hoạt động và hưởng thù lao từ ngân sách tỉnh. Khắc phục khó khăn về nguồn nhân lực, một số địa phương đã linh hoạt, phân công cán bộ, nhân viên y tế kiêm nhiệm làm công tác bảo vệ, chăm sóc trẻ em.