Trong nhiệm kỳ 2015-2020, Đảng bộ T.X Phổ Yên đã thi hành kỷ luật đối với 1 tổ chức Đảng và 132 đảng viên (trong đó khai trừ 18 trường hợp). Nội dung vi phạm chủ yếu là về nguyên tắc tập trung dân chủ, chính sách dân số kế hoạch hóa gia đình, chính sách đất đai, vi phạm đạo đức lối sống và quy định những điều đảng viên không được làm.
Nhằm giữ nghiêm kỷ luật Đảng, Ủy ban Kiểm tra các cấp của T.X Phổ Yên đã tiến hành kiểm tra 17 đảng viên và 3 tổ chức có dấu hiệu vi phạm; kiểm tra việc thực hiện nhiệm vụ kiểm tra, giám sát và thi hành kỷ luật đối với 227 tổ chức Đảng. Đồng thời, tiến hành giám sát chuyên đề với 82 tổ chức Đảng và 2 đảng viên. Nội dung giám sát tập trung vào việc thực hiện các thông báo, kết luận của cấp trên; công tác xây dựng Đảng, xây dựng cơ quan đơn vị; việc tăng cường sự lãnh đạo của Đảng về phòng chống tham nhũng, lãng phí… Bên cạnh đó, Ủy ban Kiểm tra Thị ủy Phổ Yên cũng đã tiếp nhận 53 đơn thư phản ánh, kiến nghị tố cáo, cơ bản đã giải quyết xong theo đúng trình tự quy định.